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大明天启七年（公元1627年）九月十九日，朱由校“九虞”之礼的最后一项“送葬”在几筵殿举行，丧礼由英国公张惟主持。
朱由校的灵柩静静矗立在中堂，英俊而年轻的黑白画像，就正靠在灵柩的大头。
先由太师、太傅、太保参拜灵柩，然后是三孤、三公参拜，然后是宗人府宗人令、左右宗正、左右都督、左右宗人参拜，然后是六部尚书、左右侍郎参拜，然后是京师的其他官员参拜，最后是两京十三司派入京师的代表参拜。
朱由校没有男丁，朱由检以弟弟的身份、张嫣以内眷的身份还礼，但他们的身份都是太高，没有在几筵殿下跪，只是分别站在灵柩的后面，隔着布帘躬身还礼。
所有人员参拜完毕，礼部官员鸣炮十五响，预示朱由校是大明的第十五任皇帝。
已时整，朱由校的灵柩被抬上灵车，在一片哭闹声、送行声中，灵车缓缓离开几筵殿，驶向宫门，驶向皇陵。
张嫣哭得死去活来，在灵车离开的一刹那，已经晕了过去。
即使张嫣是清醒的，作为女人，她也不能随灵￥∨，柩一道，亲眼看着朱由校下葬。她只能茫然地呆在几筵殿，灵柩离开几筵殿的时刻，就是她和夫君的永别……
丧礼完毕，全国停止一切祭祀朱由校的活动，国家同时步入正常的轨道。
九月二十二日，朱由检召见兵部在京的三大尚书崔呈秀、李春烨、王永光，四人密谈大半天，中午朱由检在乾清宫赐了宴，直到黄昏，崔呈秀、李春烨、王永光三人才离开乾清宫。
十月一日，朱由检召开第一次正式的朝会。
崔呈秀、李春烨、王永光三位兵部尚书联名抛出一份《大明军队改革方案》。
《大明军队改革方案》已经印刷多份，在朝堂散发给参加朝会的主要官员，《大明军队改革方案》主要内容有：
一、撤销京师三大营，重新编制新军；
二、新军以班为基本单位，每班十人，另外设班长一名，三个班组成一个排，三个排组
成一个连，三个连组成一个营，三个营组成一个团，三个团组成一个旅，三个旅组成一个师，三个师组成一个军。
每个军有三万三千至三万八千人。
营以上设长官一人，副长官一人，参谋一人。
三、四武营改编成新军第一军，军长袁崇焕，下辖第一师，师长李红军；第二师，师长宁显龙；第三师，师长刘玉闩。
四勇营改编成新军第二军，军长杜文焕。
四威营改编成新军第三军，军长俞冲霄。
神机营改编成新军第四军（军长洪承畴）、第五军（军长沈希夷）、第六军（军长陈有杰）。
以上各军队全部配备火器，从即日起，学习火器的使用，为期五个月。
各军配备直属军部的炮兵团。
三千营改编成新军第七、第八军，军长分别是满桂、成必用。
第七军和第八军，各下辖三个骑兵师，基本不配备火器，但配备大明最锋利的战刀、最精锐的马匹，从即日起开始整顿，为期三个月。
四、皇帝直属的亲军十六卫，除锦衣卫之外的十五卫，改编成皇家第一军、皇家第二军。
皇家第一军军长为原四武营特战队队长王慕九，皇家第二军军长为原金吾右卫指挥使李元亭。
五、待京师各军的火器配备、士兵整顿结束，再依次整顿各地方卫所军队。
六、组建大明海军。
立即以登州为母港，组建北海舰队，北海舰队附设陆战第一、第二、第三师。
逐渐以广州为母港，组建南海舰队。
七、各新军的军饷由户部直接划拨兵部，兵部按整编部队的实际情况足额发放。
八、大明军歌为《精忠报国》，军旗为蓝底红日黄月的日月旗。
军队改革在朝廷不啻于一颗重磅炸弹，但朱由检是新君初立，有些大动作，也是在所难免。
大臣们绝大多数没有在兵部任过职，对军队改革的利弊一时半会还看不清，他们都是从政治的角度去解读。
“陛下，改变之后，京师的新军达到三十多万，户部无论如何，都无法提供足额的军饷。”户部尚书李起元首先反对，他是从大明户部的实际情况出发，没有半点私人的意见。
“李大人，京师的新军，只是原来军队的改编，换个称号而已，人数没有增加，为什么原来户部能发出军饷，现在就发不出了？”李春烨早就是朱由检的坚定支持者。
“这……”李起元被打在七寸上，原来京师的军队号称三十万，但空饷严重，实际不足纸面上的六成，现在是在朝堂，李起元如何能说出口？
崔呈秀见李起元吃瘪，不禁幸灾乐祸：“军队改革，是陛下和兵部呕心流血整顿武备、提高军队战斗力的结果，稍有军事常识的人都可以看出，如果反对军队改革，就是反对兵部，反对陛下。”
崔呈秀这么早就将反对陛下的一顶帽子扣下，谁也没有发声，朝堂暂时陷入寂静。
“众爱卿，这样吧，朕和你们一条一条解读，看看到底有没有需要改进的地方。”朱由检开始偷换概念，《大明军队改革方案》是一个整体，单个的一条，与大臣们都没有什么关系。
朱由检见群臣都是无声，便对崔呈秀说：“崔爱卿，你来解读吧！”
“是，陛下。”当朝被朱由检重用，崔呈秀感到无尚的光荣，“这第一条，撤销京师三大营，重新编制新军，诸位可有异议？”
群臣都知道朱由检去奋武营、四武营后，在没有增加军饷的情况下，军队的战斗力都是大大地提高了，他们心中虽然隐隐觉得不妥，但一时之间，却是没法提出法对意见。
“好，既然没有反对的，这第一条，过。”崔呈秀也没给群臣更多的思考时间，“第二条，诸位看看，可有不妥之处？”
第二条是军队改变结构，与其他的大臣更是没有半毛钱的关系。
“第二条，过，第三条？”朝堂只有崔呈秀的声音。
第三条是军队的指挥官，除了第一师的三位师长是朱由检的人，其余的军官，基本都是东林党人，这与大明原来的军事格局也是一脉相承。
东林党人不会将自己的人驱逐出军队，阉党的人也能接受这样的结果，况且还有个崔呈秀在上蹦下窜。
“第三条，过，第四条？”
这是朱由检改组自己的亲军，可以说，这是朱由检的私事，两位军长都是朱由检的亲信，他们与两党都不沾边，两党都不会触朱由检的眉头。
“第四条，过，第五条？”
“陛下，地方卫所也要整顿？”户部尚书郭允厚虽然是阉党成员，不愿意扫崔呈秀的脸，但户部现在的财政已经枯竭，一旦皇帝要整顿地方卫所，户部必须拨出军饷，现在地方卫所的军队，户部根本不会拨给军饷，而是让他们自生自灭。
“郭大人可是担心军饷？”一直没有发言的王永光接过话头：“郭大人放心，在户部不能增加收入的情况下，在户部无力支付卫所军饷的情况下，地方卫所的军队，暂时不会整顿。”
“陛下，如此臣就放心了。”郭允厚退回自己的位置。
崔呈秀不待别人发问，赶紧高声宣布：“第五条，过，第六条？”
“陛下，大明因何要组建海军？”薛凤翔知道海军的费用庞大，成祖年间，大明的海军杨威南洋，但那时用银子堆起来的，现在大明已经日薄西山，连陆军的军饷都开不出，更别说要支撑一支庞大的舰队了。
“这……”崔呈秀和王永光都是被朱由检召见时，才听朱由检说要组建海军，他们摄于朱由检的皇威才勉强同意，至于为什么要浪费银子，他们也说不出原因。
“诸位同僚可知，大明有四大水师，分别驻守天津、登州、福建、广东，北海舰队只是将天津水师和登州水师合并而已。”李春烨也学会了忽悠，“将来组建的南海舰队，只是将福建水师和广东水师合并而已，便于统一管理。”
“原来如此。”大臣都以为朱由检是借机独揽兵权，反正国家都是他的，自己又没打算谋反，既然兵部的几位尚书都不反对，那就由他胡闹去吧！
崔呈秀见大臣们小声议论，没有人挑头反对，急忙宣布第六条获得通过，再议第七条。
第七条是军饷的下拨问题。
原来大明的军饷，是户部直接发放给各支军队，现在户部财源枯竭，军饷严重不足，各地卫所怨声载道，纷纷将矛头对准户部，就是皇帝，在寻找替罪羊的时候，也是拿户部问责。
如果军饷改由兵部直接发放给各支军队，那军饷不足的时候，户部还可以和兵部扯扯皮，至少在追究责任时，由兵部和户部共同承担。
户部的几位尚书，少有的意见一致，齐声讴歌军队改革的好处。
朱由检暗暗松了一口气，军饷由谁发放，谁就会取得对军队的直接控制权，他原本担心户部和兵部争夺军队控制权的局面没有出现。
最后一条，只具有象征意义。
《精忠报国》作为军歌，早就在四武营和军校推广了，现在只是以律令的形式确定下来。
至于军旗，谁都没有见过，也绝对不会损害现在朝堂内任何一位大臣的实际利益。