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朱天明高兴道：“没想到这几年你们取得了这么丰硕的成果，我一定要向皇帝陛下给大家请功。
真是太辛苦各位了，这次过来也着实让我受到了不小的震撼，变化真是太大了。”
这是毕懋康突然发言道：“确实这几年各院所的成果斐然，但也有个问题需要重视。
就是大量的科研也同时消耗了大量的银钱和资源，前一阵与户部和帝国银行进行过几次沟通，国库收入与存银恐怕难以支撑这样长期的大规模投入。
虽然侯爷这几年大胜，又带回不少钱粮，但还是要再想些办法增加国库收入才是。”
朱天明点头道：“这确实是个问题，我会和陛下进行商议。还有，咱们各科学院所的研究成果中有哪些可以转为民用，也可以向民间推广，以换取收益来补贴科研。”
毕懋康等人对朱天明的这个提议也表示赞同，准备之后由各院所将所有的研究成果，各自整理成详细报告交给朱天明，由其选择哪些可以商业利用。
最后彭万里又说道：“老板，现在安塞油田的开采已逐渐形成规模。第一座实验性质的炼油厂也已落成，分馏塔已经建成并开始投产。
虽然规模和产能还不算高，但我觉得可以开始内燃机的研制工作了。”
朱天明点头道：“可以开始内燃机的预研工作，对于内燃机我多少也有些经验，近期我也会尽量利用空闲时间过来给你们打个下手。”
会议结束后，朱天明前往各所观看了最新的研究成果，最后前往了军工研究院，一如既往的从轻兵器研究所顺走了一把半自动步枪和一箱子弹。
回京之后，朱天明将自己的一些想法整理成了一份书面材料。
翌日朱天明进宫见了崇祯，崇祯问朱天明去科学院的感受，朱天明对于科学院取得的进展十分激动。
崇祯道：“你来的正好，我有事想和你商量商量。你走的这三年，北直隶的兵马也已经整编完毕。
将以前的卫所兵、备倭兵等等兵马，统一整编为皇家陆军第一军及第二军，共计二十万兵力。
部队虽然已是新军，但是朝廷的指挥机构却还是原来的老样子，这样会影响新军的战斗力发挥。所以，我想全面改组军队的指挥机构。
”朱天明问道：“你想如何改组？”
崇祯道：“我想把兵部、五军都督府等军事管理指挥机构，统一整合改组为帝国统帅部，负责军队的建设、管理、训练、作战指挥及军法制定、军令传达。
随后将全国军队整编为四支武装力量，皇家禁卫军、帝国国防军、帝国内务部队和国民预备役部队。
帝国统帅部下设总参谋部、总政治部、总后勤部、总装备部、帝国国防部、皇家禁卫军。
总参谋部负责组织帝国帝国国防军的军事建设，组织指挥全国武装力量的军事行动。分管作战、情报、通信、训练、军务、动员、装备、机要、测绘、管理等职能。
总政治部负责国帝国国防军政治工作。分管政治教育、军队人事、宣传、保卫、军法、纪检、监察等职能。
总后勤部负责组织管理国帝国国防军后勤工作。分管财务、军需、卫生、军事交通、燃料物资、基建营房、建设军事设施等职能。
总装备部负责组织管理国帝国国防军装备工作。分管综合计划、军兵种装备科研订购、武器装备更新、通用装备保障等职能。
帝国国防部负责国帝国国防军的基础建设以及预备役的管理，分管兵员征集、编制、训练、退役军人事务、军事研究、预备役管理等职能。
皇家禁卫军直属于皇帝，只受皇命调遣，负责皇室人员财产安全保卫，两京卫戍以及皇帝授命的特别军事行动。
在各总部之下设立陆军部、海军部、军事情报部、帝国内务部。
陆军部与海军部之下分别设立作战司、情报司、供给司、通信司、动员司。
将锦衣卫和东厂进行拆分重组并从礼部、刑部抽调人员，其中原本负责军事情报的整合为军事情报部，
原本负责民间情报的整合为帝国安全部，原本负责要员要地安全护卫的整合为帝国内政部。”
朱天明听完沉思了好一会儿，才道：“军情、安全和内务部的职权一定要划分清楚，避免内耗。
尤其是内务部，绝对不能赋予其监察、警察和情报的职权，否则有可能演变成苏联内政部那样恐怖的怪物，甚至可能威胁到皇权。”
崇祯点头道：“是的，军事情报部只负责国内外一切与军事相关的情报、信息及特种任务。帝国安全部则是负责除军事以外的一切情报信息及安全工作。
帝国内务部负责重要工业、国家设施保卫，交通干线保卫，消防、人防建设、管理及保卫，民兵训练及管理，边防、国家档案管理等工作。”
朱天明道：“嗯，我琢磨了一下，军事只管管理机构的改革应该阻力不会太大。
五军都督府基本上是由英国公和我叔祖掌控，兵部那边嘛，崔呈秀只要在统帅部里给他留个高位，应该也不会有太大的阻力。
至于锦衣卫和东厂，李若琏、高文采和曹化淳本都是绝对忠于你的，更不会有什么问题。只要把各个要害部门的长官人选定好，改组应该会比较顺利。”
崇祯道：“人选我也有所考虑，我打算由你出任总参谋长，英国公出任总政治部长，成国公任总后勤部长，毕懋康任总装备部长，崔呈秀任国防部长，皇家禁卫军军长依然由你兼任。
唐小虎任陆军部长，李洋任陆军部次长，萧肃任海军部长，郑芝龙任海军部次长，万胜任海军陆战队司令，高文采任军事情报部部长，你父亲任帝国内务部部长。”
朱天明问道：“毕懋康出任总装备部部长的话，科工部左侍郎怎么办？”
崇祯道：“由宋应星接任科工部左侍郎，彭万里接任皇家科学院院长。”
朱天明点了点头，又摇了摇头道：“还有一件事不妥，国防军和禁卫军不能由一个人控制，从一开始就不能开这个先河。
我建议让张之极出任皇家禁卫军军长，朱嘉赫任副军长。这样使权力分散开，相互制衡不至于一家独大。”
崇祯笑道：“不用那么麻烦吧，我还能信不过你？”
朱天明严肃道：“但我信不过以后的人。我可不想以后出个把持军权专权跋扈的家伙，再搞的天下大乱。
还有一点，必须要明确宣示，皇帝为帝国统帅部最高统帅，以避免今后有人钻空子找漏洞，将皇权排除在统帅部之外。”
闻言，崇祯也严肃的点了点头。朱天明又说道：“皇帝不能不掌握军权，不能不懂军事。所以，我建议自慈烺开始，历任太子都要进入皇家军事学院学习。
并且为太子组建一支小规模的专属部队，由太子亲自操练指挥，并适当的参与指挥一些低烈度的军事行动。”
崇祯想了想道：“有道理，那就为慈烺组建一支直属东宫的部队，编制为一个团，就叫‘东宫羽卫司’吧。”
朱天明又问道：“那改组之后的帝国安全部怎么设置？”
崇祯道：“与六部平齐，由李若琏管理。”
朱天明问道：“那曹化淳如何安置？”
崇祯道：“曹化淳改授司礼监秉笔。”
朱天明点头道：“我还有一个小建议，我觉得应该将方正化的宦官身份除去，改列为朝臣。
因为按大明祖制宦官最高授予四品官衔，可是皇家卫队队长可是正师级，应该授予中将军衔呀。”
崇祯想了想，道：“你说的有理，之前我还真忽略了。”