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却说轩辕回到人族之后，和自己的父母见面自是不提。这个时候，由于轩辕已经成年，少典氏把部落之长的位置让给自己的儿子，然后退位，而轩辕氏也正是改名为公孙轩辕。轩辕继位为族长之后，觉得神农氏留下的烧山垦荒的办法不好，于是加以改进。采取固定的耕田方式，在水源充足的地方建立固定的耕田，然后以人畜方便之物为肥料，自此之后，轩辕的部落就没有过缺粮，歉收的事情发生。然后轩辕把这种方法传给附近的部落，这样一来，有熊部落就在附近的几个部落之中声名鹊起，然后轩辕在农闲之时选取部落之中精壮男丁，组成军队，加以训练。慢慢的有熊部落成了轩辕丘附近几大部落之中最强大的部落，不少部落纷纷依附。
一时之间，有熊，罴，貅，豹，虎，雕，鹰，鸢，？九大部落归附。轩辕都按照有熊部落一般训练，慢慢的公孙轩辕的名声响彻地仙界人族。而神农飞升之后留下了人皇的位置空着，神庙之中的祭司正在为人皇之位发愁，此时正巧发现了轩辕，觉得轩辕拥有领导人族的潜力，准备立轩辕为第三任人皇。只是，虽然轩辕现在名声是有了，但是却是没有立过大功于人族，暂时还不能传位。
正好在这个时候，发生了一件大事，人族贤者遂人氏的后代子孙仓颉，创造了人族的文字，为人族历史的传承立下大功，本来以仓颉的想法，自己立下如此的大功，应该能够继任人皇之位了，但是后来他听到神庙之中传出消息，轩辕被内定为下任的人皇，心有不服，于是起兵作乱。这样一来，就给了轩辕机会，神庙之中的祭司马上下令轩辕带兵前去平乱。仓颉哪里是轩辕的对手，他虽然创造了文字，却对军事一窍不通，被轩辕打得大败。轩辕以仓颉于人族有大功，于是在仓颉战败之后，前去招降，仓颉见到轩辕如此仁义，遂投降，成为了轩辕的助手。
轩辕得胜之后，长老团看轩辕不光统兵打仗能力强悍，而且还仁义无双。正是有人皇的资质，于是开始暗中的扶持有熊部落。人族的一些大事也叫轩辕来处理。轩辕也不负众望，把人族治理的井井有条。现在人皇的位置基本是定了。但是事情却不是那么简单，轩辕注定不能和上两任人皇一般，以功德成就人皇之位，他的机缘在于战争。
就在轩辕还在为人族的昌盛努力的时候，南瞻部洲之中也正有一个部落在发展着，这个部落的首领叫做蚩尤，而部落的名字叫做九黎。蚩尤是轩辕天定的对手，也是有大智慧的人，只是他的身份很是特殊，他的本身却是巫族之中的大巫，不知道因为什么原因竟然有了元神。本来巫族之人身死之后，都会回归大地，回到自己的祖先盘古的怀抱，但是蚩尤有了元神，在巫，妖大战的时候，身死之后，竟然进入了轮回，转世投胎成了人族，降生在了南瞻部洲的九黎部落，并且凭借着自己前世的记忆和今世的努力，成为了族长。
随着时间的发展，蚩尤觉醒了自己前世大巫的血脉，一身法力强悍无比。现在的情况却是轩辕的有熊部落基本统一了东胜神洲，而蚩尤的九黎部落却统一了南瞻部洲，二人分庭抗礼，而蚩尤在大巫血脉觉醒之后，不知道通过什么样的途径，竟然请出了祖巫殿之中的三位大巫帮助他争夺人皇之位，而他选择的方法最是简单，战争，打败所有的竞争者，自己自然就成了人皇。但是蚩尤的想法和东胜神洲的人族的想法根本就不一样，因为人族的神庙在东胜神洲，而且前两任人皇都降世在东胜神洲，在人们的潜意识里面，东胜神洲才是人族的正统所在，你蚩尤现在既没有名声，也没有为人族做出贡献，你凭什么继任人皇之位，所以战争不可避免的发生了。
但是这个时候就不得不说为什么蚩尤是轩辕的天定对手了，蚩尤之所以敢以发动战争的形势来争夺人皇之位，他也是有着万全的准备的。蚩尤已经统一了南瞻部洲的八十一个部落，而且他还在庐山发现了铜矿，改良了铸造技术，制造出了青铜武器，这就远远的领先了轩辕的有熊部落。可以想象当金属的武器和那些还是木头，石头制成的武器发生碰撞的时候，会发生什么样的事情。
正是因为这个原因，轩辕和蚩尤交战不能取胜，又看到蚩尤治军有方，而且也算把南瞻部洲治理的井井有条，轩辕觉得蚩尤也是一个和自己一样有能力成为人皇的人，觉得如果一旦两个大洲开战的话，对人族来说是一种莫大的损失。所以轩辕觉得还是议和的好，甚至还提出让出人皇之位的建议。
但是这个时候，蚩尤却不想要议和，他已经知道了东胜神洲的实力，和自己的实力根本不可同日而语。顿时骄傲起来，心道：“凭我蚩尤的本事，人皇之位本来就是非我莫属，何用你轩辕让我，搞的好像是我蚩尤小肚鸡肠，不满你做人皇似的。”于是拒绝了轩辕讲和的建议，要凭借武力夺取人皇之位。
轩辕看到蚩尤不听劝告，而且还屡次率兵侵犯东胜神洲，也来了脾气心道：“蚩尤如此的残暴，若是自己真以人皇之位想让的话，那可就苦了人族百姓了。自己再也不能姑息蚩尤，否则就要养虎为患了。”于是亲统大军于蚩尤交战。但是轩辕一方先天上面的不足，使得轩辕黄帝做战失利。轩辕无奈之下，只好返回自己的师门求救，于是才有了彩云仙子三人在天生的炼器室外等天生出来的事情。
于是天生顺势赐下崆峒印和用屠巫剑为本体，重新炼制出来的轩辕剑，让梅傲雪赐予轩辕，以助他和蚩尤交战。只是虽然天生赐下了灵宝，奈何两个大洲的战争，各人的力量实在是太小了，真正交战起来，还是士兵之间的战斗。所以轩辕现在还是处于不利的局面。这个时候就不是天生能够帮助轩辕的了，这是天道给轩辕这个人皇的考验，只有过了这个难关，轩辕才能成就人皇，站立在天地人三界这个金字塔的顶端。
不说轩辕的事情，单说天生。她答应了后土去给祖巫殿设下守护大阵。所以在又一次出关之后，就骑乘着机关飞熊，向着祖巫殿的方向而去。其实，即使天生不去祖巫殿也没有什么事情，因为祖巫殿外面还有当初天生留给巫族的周天星斗大阵存在，尽管是没有阵眼的大阵，却也可以发挥出七层的威力了。
天生到了祖巫殿之后，大巫九凤和相柳两人接到天生，把天生让进了祖巫殿之中。天生问道：“刑天他们是怎么回事？怎么会参与到人族的争斗之中去了？”
九凤和相柳对视了一下，说道：“我们也不知道是怎么回事，本来我们的任务只是守护祖巫大殿，但是蚩尤来了之后，也不知道和他们说了什么，这三个人就再也坐不住了，就好像祖巫大殿像监牢一样，在里面怎么呆着怎么别扭。”
天生问道：“那蚩尤怎么没有找你们？”
相柳接着道：“可能是我们和蚩尤不熟的缘故吧。您知道，即使是大巫之间，也是有亲疏之分的。我觉得刑天他们之所以会被蚩尤说动，一是因为他们和蚩尤是好友，这在洪荒的时候就是了；二，可能使我和九凤的性格和刑天他们不一样，他们太好战了，以前没事的时候，他们三人都会斗上一阵，如今有了这个机会，哪里还坐的住，尤其是刑天，他可是号称祖巫之下第一人，之所以会有这个称号完全是打回来的，巫族之中除了祖巫大人，没有一个大巫是他的对手，这些年可能也是太寂寞了。”
天生点点头，说道：“看来后土姐姐说的对，你们毕竟是活人，如果只能呆在祖巫大殿之中不能出来，岂不是和死人一样。”顿了一下，天生接着说道：“好了，我这次来是给你们传达后土姐姐的旨意，你们可以出去了，不管是返回地府，还是去什么别的地方都可以。我来就是给祖巫大殿加强防御的，你们看有没有要收拾的，有的话就收拾一下，然后我们离开这里。”
收拾完一切之后，天生三人出了祖巫大殿，天生看着大殿外面那缺少阵眼的周天星斗大阵，有心收了，但是转念一想还是别了。这三百六十五面星辰幡都是人家巫族之人自己炼制的，自己贪了不好。想通这一点之后，天生又重新的加固了一番周天星斗大阵，然后又在大阵里面布置上各种空间陷阱，什么断层，裂缝的，不计其数，还留下了一点空间坐标，预防以后万一有人进入了祖巫大殿，天生也好有个准备。
“你们想好去什么地方没有？”天生做完一切之后询问着九凤和相柳。